1.     Ng, P. C.; Henikoff, S. Annu Rev Genom Hum G 2006, 7, 61-80.

2.     Bjørheim, J.; Abrahamsen, T. W.; Kristensen, A. T.; Gaudernack, G.; Ekstrøm, P. O. Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis 2003, 526(1-2), 75-83.

3.     Cargill, M.; Altshuler, D.; Ireland, J.; Sklar, P.; Ardlie, K.; Patil, N.; Lane, C. R.; Lim, E. P.; Kalyanaraman, N.; Nemesh, J.; Ziaugra, L.; Friedland, L.; Rolfe, A.; Warrington, J.; Lipshutz, R.; Daley, G. Q.; Lander, E. S. Nat Genet 1999, 22(3), 231-238.

4.     Chakravarti, A. Nature 2001, 409, 822-823.

5.     Stoneking, M. Nature 2001, 409, 821-822.

6.     Liu, Q.-R.; Drgon, T.; Johnson, C.; Walther, D.; Hess, J.; Uhl, G. R. Am J Med Genet B 2006, 141B(8), 918-925.

7.     Stenson, P. D.; Ball, E. V.; Mort, M.; Phillips, A. D.; Shiel, J. A.; Thomas, N. S. T.; Abeysinghe, S.; Krawczak, M.; Cooper, D. N. Hum Mutat 2003, 21(6), 577-581.

8.     Sherry, S. T.; Ward, M. H.; Kholodov, M.; Baker, J.; Phan, L.; Smigielski, E. M.; Sirotkin, K. Nucleic Acids Res 2001, 29(1), 308-311.

9.     Fredman, D.; Munns, G.; Rios, D.; Sjoholm, F.; Siegfried, M.; Lenhard, B.; Lehvaslaiho, H.; Brookes, A. J. Nucleic Acids Res 2004, 32(suppl_1), D516-519.

10.  Yip, Y. L.; Scheib, H.; Diemand, A. V.; Gattiker, A.; Famiglietti, L. M.; Gasteiger, E.; Bairoch, A. Hum Mutat 2004, 23(5), 464-470.

11.  Ng, P. C.; Henikoff, S. Genome Res 2001, 11(5), 863-874.

12.  Ramensky, V.; Bork, P.; Sunyaev, S. Nucleic Acids Res 2002, 30(17), 3894-3900.

13.  Bao, L.; Cui, Y. FEBS Letters 2006, 580(5), 1231-1234.

14.  Chasman, D.; Adams, R. M. J Mol Biol 2001, 307(2), 683-706.

15.  Barenboim, M.; Jamison, D. C.; Vaisman, I. I. Hum Mutat 2005, 26(5), 471-476.

16.  Barenboim, M.; Masso, M.; Vaisman, I. I.; Jamison, D. C. Proteins 2008, 71(4), 1930-1939.

17.  Ferrer-Costa, C.; Orozco, M.; Cruz, X. d. l. Proteins 2004, 57(4), 811-819.

18.  Ferrer-Costa, C.; Orozco, M.; Cruz, X. d. l. Proteins 2005, 61(4), 878-887.

19.  Chan, P. A.; Duraisamy, S.; Miller, P. J.; Newell, J. A.; McBride, C.; Bond, J. P.; Raevaara, T.; Ollila, S.; Nyström, M.; Grimm, A. J.; Christodoulou, J.; Oetting, W. S.; Greenblatt, M. S. Hum Mutat 2007, 28(7), 683-693.

20.  Dobson, R.; Munroe, P.; Caulfield, M.; Saqi, M. BMC Bioinformatics 2006, 7(1), 217.

21.  Krishnan, V. G.; Westhead, D. R. Bioinformatics 2003, 19(17), 2199-2209.

22.  Bao, L.; Cui, Y. Bioinformatics 2005, 21(10), 2185-2190.

23.  Li, B.; Krishnan, V. G.; Mort, M. E.; Xin, F.; Kamati, K. K.; Cooper, D. N.; Mooney, S. D.; Radivojac, P. Bioinformatics 2009, 25(21), 2744-2750.

24.  Cai, Z.; Tsung, E. F.; Marinescu, V. D.; Ramoni, M. F.; Riva, A.; Kohane, I. S. Hum Mutat 2004, 24(2), 178-184.

25.  Needham, C.; Bradford, J.; Bulpitt, A.; Care, M.; Westhead, D. BMC Bioinformatics 2006, 7(1), 405.

26.  Verzilli, C. J.; Whittaker, J. C.; Stallard, N.; Chasman, D. J R Stat Soc C-Appl 2005, 54, 191-206.

27.  Yue, P.; Li, Z.; Moult, J. J Mol Biol 2005, 353(2), 459-473.

28.  Yue, P.; Moult, J. J Mol Biol 2006, 356(5), 1263-1274.

29.  Ye, Z.-Q.; Zhao, S.-Q.; Gao, G.; Liu, X.-Q.; Langlois, R. E.; Lu, H.; Wei, L. Bioinformatics 2007, 23(12), 1444-1450.

30.  Capriotti, E.; Calabrese, R.; Casadio, R. Bioinformatics 2006, 22(22), 2729-2734.

31.  Capriotti, E.; Arbiza, L.; Casadio, R.; Dopazo, J.; Dopazo, H.; Marti-Renom, M. A. Hum Mutat 2008, 29(1), 198-204.

32.  Ng, P. C.; Henikoff, S. Genome Res 2002, 12(3), 436-446.

33.  Ng, P. C.; Henikoff, S. Nucleic Acids Res 2003, 31(13), 3812-3814.

34.  Thomas, P. D.; Campbell, M. J.; Kejariwal, A.; Mi, H.; Karlak, B.; Daverman, R.; Diemer, K.; Muruganujan, A.; Narechania, A. Genome Res 2003, 13(9), 2129-2141.

35.  Breiman, L. Mach Learn 2001, 45, 5-32.

36.  Care, M. A.; Needham, C. J.; Bulpitt, A. J.; Westhead, D. R. Bioinformatics 2007, 23(6), 664-672.

37.  Schneider, G.; Wrede, P. 1994, 66(2), 335-344.

38.  Grantham, R. Science 1974, 185(4154), 862-864.

39.  Reczko, M.; Karras, D.; Bohr, H. Nucleic Acids Res 1997, 25(1), 235-235.

40.  Sokal, R. R.; Thomson, B. A. Am J Phys Anthropol 2006, 129(1), 121-131.

41.  Cid, H.; Bunster, M.; Canales, M.; Gazitua, F. Protein Eng 1992, 5(5), 373-375.

42.  Bhaskaran, R.; Ponnuswamy, P. K. International Journal of Peptide and Protein Research 1988, 32(4), 241-255.

43.  Charton, M.; Charton, B. I. Journal of Theoretical Biology 1982, 99, 629--664.

44.  Chothia, C. Journal of Molecular Biology 1976, 105(1), 1-12.

45.  Pontius, J.; Richelle, J.; Wodak, S. J. Journal of Molecular Biology 1996, 264(1), 121-136.

46.  Fauchère, J.-L.; Charton, M.; Kier, L. B.; Verloop, A.; Pliska, V. International Journal of Peptide and Protein Research 1988, 32(4), 269-278.

47.  Jones, D. T.; Taylor, W. R.; Thornton, J. M. Comput Appl Biosci 1992, 8(3), 275-282.

48.  Li, Z. R.; Lin, H. H.; Han, L. Y.; Jiang, L.; Chen, X.; Chen, Y. Z. Nucleic Acids Res 2006, 34(suppl_2), W32-37.

49.  Kennard, R. W.; Stone, L. A. Technometrics 1969, 11, 137-148.

50.  Bylander, T. Mach Learn 2002, 48(1), 287-297.

51.  Archer, K. J.; Kimes, R. V. Comput Stat Data An 2008, 52(4), 2249-2260.

52.  Baldi, P.; Brunak, S.; Chauvin, Y.; Andersen, C. A. F.; Nielsen, H. Bioinformatics 2000, 16(5), 412-424.

53.  Matthews, B. W. Biochim Biophys Acta 1975, 405, 442-451.

54.  Golbraikh, A.; Tropsha, A. J Mol Graph Model 2002, 20(4), 269-276.

55.  Tropsha, A.; Gramatica, P.; Gombar, V. K. QSAR Comb Sci 2003, 22(1), 69-77.